TAHUN 2009
Tanda Penghargaan Peringkat I kategori Perpustakaan Terbaik di Lingkungan DEPKES.
TAHUN 2012
Certificate of Registration ISO 9001 : 2002 Library Service.
TAHUN 2016
Piagam Penghargaan Juara III, Pemilihan Perpustakaan Terbaik di Lingkungan Kemenkes Tahun 2016.
TAHUN 2017
Penghargaan Kepada Pemenang Lomba dalam Rangka Hari Kesehatan Nasional Tahun 2017 Kepada Sapto Harmoko Poltekkes Kemenkes Yogyakarta sebagai Juara III, Perlombaan Pustakawan Berprestasi .
TAHUN 2018
Sertifikat Keanggotaan dalam jejaring Indonesia OneSearch Perpustakaan Nasional RI.
Juara Harapan III Pemilihan Perpustakaan Terbaik di Lingkungan Kemenkes Tahun 2018.